慕容复三年任期未满，此时突然请求外放，纵然理由冠冕堂皇太皇太后仍不免有些诧异，思索片刻便知想必是那“苏门走狗，妄攀龙凤”八个字伤了他的心。太皇太后沉吟片刻后道：“官家对你十分信任，此事容后再议。”太皇太后老而弥辣，深知她的孙儿性子有些孤僻，并且心中十分偏向新党。她年事已高，也不知还有几个春秋。如今眼见慕容复与自己的孙儿相处融洽，而他本人又有才干，便想将他留在小皇帝身边慢慢对小皇帝潜移默化。
慕容复见自己的请求没有得到许可也就不再多言，又陪太皇太后闲聊了一阵后便告辞离去。好在太皇太后也知先前令慕容复受了不少委屈，现在又拒绝他唯一的请求有点说不过去。是以，不久便下旨令慕容复协助范纯仁整理朝廷规制以备改进。
范纯仁早知蜀党上下虽说以苏轼为党魁，但真正能发号施令使人信服的正是慕容复。范纯仁接手朝廷制度改革一事正愁独木难支，太皇太后有此召令原是正中下怀，急忙邀请慕容复过府相商。改革朝廷官僚制度、提高官员办事效率、节约行政成本，这本是慕容复一心要做的事。范纯仁有心倚重他，慕容复自然是当仁不让推心置腹，在划分皇权与臣权界限、打开吏员晋升官身通道、明确官员任期考核项目、肃清官场贪庸风气等方面均提出了自己的意见。慕容复本是穿越而来，目光之长远远甚当代精英，所提出的建言皆切中要害便于操作，直令范纯仁拍案叫绝。
范纯仁带领三省六部各级长官经反复磋商终于于元祐六年八月间厘清改制条目上疏太皇太后，自上而下进行官僚制度的改革。由于本次改革乃是摸石过河缓缓而行，并且非但不曾精简人员反而多设了纪检、监察等数个官僚机构，使北宋时数量巨大的冗官有了着落，因此并未见大面积的反对声浪。本次官僚制度的改革乃是北宋时期朝廷官员对官僚制度的一次深刻反思与革新，改革之后北宋时期的冗官问题得到了有效的改善，官员的任用与罢免规则也得到了完善。同时由于进士以吏员起步、任期考核标准细化这两条规则的落实，使得官员贪污的成本进一步提高，有效遏制了朝廷贪污风气吏治为之一新，为大宋未来开疆拓土牧民向化奠定了坚实的基础，史称“元祐更新”。
慕容复忙于官僚制度改革一事，对崇政殿说书的工作便有些疏忽懈怠。到了十月间，便是迟钝如小皇帝也隐隐感觉到慕容复数月来借口改制一事总往庆寿宫跑对他却不如往昔。这一日，慕容复完成说书的工作正要告辞离去，小皇帝却忽而道：“慕容卿若是无事，可愿陪朕闲坐一会？”
小皇帝有此要求，慕容复纵然有事也得留下便躬身称是。小皇帝当下微微一笑，令慕容复陪他一同返回福宁殿。两人刚在福宁殿坐定，便有内侍送上了茶点。小皇帝在随意招呼了慕容复几句后，很快便进入主题问起了改制一事。
慕容复虽说已对小皇帝的心性十分失望，但却并无糊弄敷衍小皇帝的想法。眼见小皇帝关心改制一事，当下便侃侃而言，将官僚制度改革一事的好处和将要面对的困难都说了个通透。
改制一事原是千头万绪十分繁琐，但听慕容复说来却是有条不紊清楚明晰，小皇帝听了也不由连连点头，只叹道：“改制一事由上至下逐步推进果然稳妥。”
“正是，”慕容复亦点头道，“朝廷规制牵一发而动全身，本就是如何稳妥都不为过。如今这般改制由上而下由小及大，正便于朝廷严密监控，若事有不协便可即刻终止。所谓国以民为本，只要不伤了百姓，无论怎么改都不算伤筋动骨。”
“慕容卿老成谋国，此乃百姓之福。”此次改制进一步加强了皇权，小皇帝自然也是乐见其成，当下笑赞了慕容复一句。“只是有一事，慕容卿未曾考虑周详。”
慕容复闻言当即把眉一挑，欠身道：“还请官家示下。”
“官俸！”小皇帝沉声道，“原本在家侯旨的官员可以俸禄减半甚至不给俸禄，至于吏员的俸禄听闻更是极低。若是改制，更多的赋闲的官员出来做事，俸禄又要从何处度支呢？”
“若是朝廷税赋收入不足，自当设法开源。若是一昧节流压缩行政成本，则朝廷对地方的控制必然乏力，那就更加收不上税来。长此以往，岂非恶性循环？”慕容复当即笑道。
小皇帝闻言却是面色阴沉，冷声道：“当年父皇锐意改革便是因为这个缘故，如今又是何等下场？”
慕容复低头凝望了面前的碗碟一阵，许久方幽声道：“官家，石头缝里哪里榨得出油水来呢？”
慕容复的话这般直白，小皇帝也不禁压低了嗓音。“可惜如慕容卿这般忠枕为国的，毕竟是少数。”
慕容复见小皇帝这般灵醒，当即抬头笑道：“官家错了，这世间最富贵的并非儒家啊！”
小皇帝还想再问，慕容复却已不愿再回答，只轻轻地摇了摇头便要起身告辞。
怎知小皇帝看了眼外面